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Les énoncés fonctionnels font problème du point de vue de la méthodologie des sciences de la nature : ils semblent expliquer les causes à partir de leurs effets. Les philosophes des sciences contemporains ont tenté de résoudre ce problème en montrant que les énoncés fonctionnels peuvent être traduits en formules causales ordinaires, sans perte de sens. Sont examinées successivement la solution d'Ernest Nagel (1961), la théorie « étiologique » (Wright 1973) et la théorie systémique (Cummins 1975). Ces conceptions sont examinées du double point de vue de leur cohérence et de leur signification pour la pratique biologique.
Biologie des causes prochaines, Biologie des causes ultimes, Fonction, Philosophie des sciences, Téléologie, Théorie étiologique, Théorie systémique