Comptes Rendus Palevol
11 (8) - Pages 563-566En cladistique, ne bénéficiant d’aucun logiciel adéquat, l’analyse à trois éléments (3ia) est moins répandue que la parcimonie (MP), bien que fréquemment utilisée en biogéographie historique. LisBeth est le premier et unique logiciel de 3ia pour la phylogénie et la biogéographie, disponible gratuitement, et développé à partir de propositions théoriques déjà publiées et originales. LisBeth ne repose pas sur la représentation matricielle conventionnelle, les caractères étant des arbres racinés dont sont issues les hypothèses à trois éléments, parmi lesquelles LisBeth recherche la congruence maximale. LisBeth reconstruit un arbre qui diffère des consensus habituels : l’arbre d’intersection. En biogéographie, la « méthode transparente » et « l’analyse des sous-arbres libres de paralogie » sont implémentées pour gérer les taxons à distributions larges et/ou redondantes. Dans un souci d’interopérabilité, LisBeth peut importer/exporter des matrices de caractères au format NEXUS, rendant ainsi comparables les différentes approches cladistiques. Un import existe aussi à partir des bases de connaissances Xper 2 .
Cladistique, Évolution, Phylogénétique, Biogéographie historique
