Pour étudier les relations phylogénétiques entre les espèces de Pinnixa White, 1846 sensu lato et d’autres pinnotheridés étroitement apparentées, nous avons reconstruit une phylogénie moléculaire sur la base du complexe mitochondrial 16S-NADH1, du 12S mitochondrial et de l’histone 3 nucléaire. La polyphylie de Pinnixa s.l. a été confirmée par des analyses en maximum de vraisemblance. Selon notre définition restreinte, le genre Pinnixa sensu stricto n’est représenté dans ces analyses que par son espèce type, Pinnixa cylindrica (Say, 1818). Sur la base de ces analyses moléculaires, en combinaison avec des études morphologiques, douze espèces sont réaffectées à des genres existants : Pinnixa faba (Dana, 1851), Pinnixa franciscana Rathbun, 1918, Pinnixa littoralis Holmes, 1894, Pinnixa schmitti Rathbun, 1918 et Pinnixa tubicola Holmes, 1894 sont placées dans le genre Scleroplax Rathbun, 1893. Laminapinnixa miamiensis McDermott, 2014, Laminapinnixa faxoni (Rathbun, 1918), Pinnixa abbotti Glassell, 1935, Pinnixa arenicola Rathbun, 1922, Pinnixa floridana Rathbun, 1918, Pinnixa leptosynaptae Wass, 1955 et Laminapinnixa vanderhorsti (Rathbun, 1924) sont réaffectés à Glassella Campos & Wicksten, 1997, les deux derniers strictement sur des bases morphologiques. De plus, trois nouveaux genres sont érigés pour recevoir neuf espèces : Rathbunixa n. gen. comprend les membres du complexe Pinnixa pearsei Wass, 1955 – Pinnixa sayana Stimpson, 1860, Pinnixa affinis Rathbun, 1898 et des espèces du complexe Pinnixa californiensis Rathbun, 1894 – Pinnixa occidentalis Rathbun, 1893 ; Tubicolixa n. gen. est érigé pour recevoir Pinnixa chaetopterana Stimpson, 1860 et le Pinnixa brevipollex Rathbun, 1898 – complexe Pinnixa rapax Bouvier, 1917 – ; et Sayixa n. gen. représente une nouvelle combinaison pour Pinnixa monodactyla (Say, 1818).
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