Mucoralean fungi in Thailand: novel species of Absidia from tropical forest soil

Les espèces d’Absidia Tiegh. (Mucorales) sont généralement isolées du sol, des matières végétales mortes et des excréments. Le genre présente un intérêt dans les domaines industriel et médical en raison de la présence de composés actifs et de métabolites secondaires. Les espèces Absidia sont typiquement caractérisées par un stolon arqué avec des rhizoïdes, des zygospores avec des suspenseurs appendus et des columelles avec des projections apicales. La caractérisation et la description des nouvelles espèces d’Absidia sont sans précédent en Thaïlande. Au cours de nos visites sur le terrain pour explorer les champignons du sol dans le nord de la Thaïlande, des échantillons de terre végétale ont été prélevés dans une forêt tropicale mixte à Chiang Mai. Quatre souches Absidia ont été isolées à partir des échantillons de sol. Les caractéristiques morphologiques initiales ont révélé que quatre souches représentent deux nouvelles espèces. L’analyse phylogénétique des données de séquences combinées ITS, SSU, LSU et ACT-1 a révélé que les deux nouvelles espèces sont phylogénétiquement distinctes. L’examen microscopique a indiqué que la nouvelle espèce Absidia soli V.GHurdeal., E.Gentekaki., H.B.Lee & K.D.Hyde, sp. nov. produit des sporanges (16-51 × 15-45,5 μm) et des columelles (7,5-12,5 × 9-24 μm) plus grands que Absidia edaphica V.GHurdeal., E.Gentekaki., H.B.Lee & K.D.Hyde, sp. nov. (30,5-35,5 × 24-27 μm et 5-9,5 × 6,5-20 μm respectivement). Les deux espèces ont des sporangiospores cylindriques courts à cylindriques et hyalines. Les tailles des spores pour A. edaphica sp. nov. et A. soli sp. nov. sont respectivement de 3,5-5,5 × 2-3,5 μm et de 3-4,5 × 1,5-2,5 μm. La croissance mycélienne a été mesurée dans quatre milieux, à savoir l’agar d’extrait de malt (MEA), l’agar dextrose de pomme de terre (PDA), l’agar de farine de maïs (CMA) et l’agar de malt de levure (YMA). Les deux espèces croissent entre 4 à 30°C, mais pas à > 37°C. L’analyse basée sur un échantillonnage plus large des taxons et sur l’ensemble des données LSU a révélé qu’il existe une grande diversité phylogénétique des espèces d’Absidia.