La transition du Permien au Trias, contemporaine de la plus importante phase d'extinction de l'histoire de la vie, est caractérisée par la disparition des récifs édifiés par les métazoaires. Il lui succède une longue période d'une réorganisation complète des écosystèmes récifaux. La restructuration des récifs était continue, impliquant une succession d'étapes, depuis l'optimum récifal du Permien jusqu'à l'entière disparition des récifs à métazoaires, leur absence prolongée pendant le début du Trias et, finalement, leur reconquête progressive au cours du Trias moyen. Lors des extinctions massives de la fin du Permien, les métazoaires constructeurs de récifs subirent une crise majeure par suite d'une diminution dramatique, plus de 99%, de la production de carbonates provenant d'organismes récifaux à squelettes calcaires. Après les extinctions, la relève fut assurée durant un intervalle de 5 à 6 Ma, c'est-à-dire durant toute la durée du début du Trias, par des récifs microbiens édifiés sans la participation de métazoaires. Cette résurgence des récifs microbiens a été largement étudiée et a été interprétée comme significative d'un stress environnemental de longue durée, en relation avec les extinctions massives de la fin du Permien, qui ont empêché la reconquête des métazoaires, tout en stimulant conjointement le développement des microbialites. Au cours du Trias moyen, les récifs à métazoaires réapparaissent, mais leur biodiversité n'atteindra un niveau comparable à celui d'avant la crise, qu'à la fin du Trias.
Début du Trias, récifs microbiens, reconquête biologique, crise biologique de la fin du Permien