A practical guide to molecular dating

La datation moléculaire est devenue un outil commun pour de nombreux biologistes et des progrès méthodologiques considérables ont été apportés ces dernières années. Cependant, l’estimation des temps de divergence à partir de données moléculaires demeure très variable dans sa pratique et sa mise en œuvre est délicate pour le novice. Cet article propose une revue concise de l’état de l’art de la pratique de la datation moléculaire. Plusieurs décisions importantes sont nécessaires, notamment la sélection et l’implémentation des calibrations, ainsi que le choix d’un modèle d’horloge relâchée et le logiciel pour l’analyse. Après une discussion de certains aspects pratiques de la conduite de ces analyses, plusieurs règles sont proposées pour l’interprétation des résultats. Les alternatives possibles pour obtenir des temps de divergence sont également discutées. Enfin, plusieurs développements prometteurs pour l’avenir de la discipline sont soulignés, en particulier dans le cadre de l’amélioration du processus de calibration.