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Une histoire de géométrie et de finesse (ou : comment parler de phylogénétique ?)

Pascal TASSY

fr Comptes Rendus Palevol 10 (5-6) - Pages 341-346

Publié le 30 septembre 2011

Cet article est tiré de la thématique Perspectives sur l’évolution des vertébrés : thèmes et problèmes

Le développement des méthodes phylogénétiques au début des années 1970 est évoqué au moyen de l’image pascalienne empruntée à Armand de Ricqlès et remontant à 1975 : le triomphe de l’esprit de géométrie sur l’esprit de finesse. L’émergence et la consolidation de la cladistique correspondent à l’esprit de géométrie (le principe de congruence de Hennig – images phylogénétiques congruentes – est emprunté à la géométrie même). Cependant, la finesse anatomique étant garante de la qualité d’une matrice de données taxons × caractères, l’aspect qualitatif des arbres parcimonieux n’a jamais été absent. Les approches statistiques probabilistes, munies de mathématiques sophistiquées, se sont ensuite peu à peu imposées à la suite de débats où les polémiques n’étaient pas absentes. L’omniprésence actuelle des approches moléculaires probabilistes n’est pas sans ambiguïté et pose à nouveau la question de l’alternative : finesse ou géométrie des modèles évolutifs.


Mots-clés :

Phylogénie, Cladistique, Maximum de vraisemblance, Méthode bayésienne, Parcimonie

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