Cette étude présente les variations ultra-structurelles de la lorica chez les populations naturelles de Trachelomonas caudata et des taxons proches. En s’appuyant sur ces variations, des incohérences dans le traitement taxonomique des euglénoïdes ont été mises en évidence. Les loricae de T. caudata et des taxons proches ont été examinés au microscope photonique, microscopie électronique à balayage et par spectroscopie à rayon X à dispersion d’énergie (EDS). Cette dernière approche a montré des similarités dans la composition chimique entre les loricae de différents taxons putatifs, avec comme éléments principaux fer et silicium, et l’absence d’un élément chimique considéré comme constitutif important des enveloppes de Trachelomonas, le manganèse. L’ensemble des morpho-types observés ont été classé dans un complexe basé sur la structure de l’enveloppe, le complexe « caudatae ».