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L’European Journal of Taxonomy lance son portail de données hébergé par le GBIF

L'European Journal of Taxonomy (EJT) - une revue électronique en open access diamant de premier plan pour la recherche taxonomique - est devenue la première revue scientifique à lancer un portail hébergé par le GBIF, ouvrant ainsi la voie à d'autres éditeurs académiques souhaitant rejoindre le programme. Cette initiative vise à améliorer l'accès, la réutilisation et l'interopérabilité du matériel cité, historiquement enfermé dans des fichiers PDF, désormais diffusé par le biais de datasets.

Les utilisateurs peuvent explorer plusieurs fonctionnalités telles que le regroupement de données qui permet de découvrir des occurrences potentiellement apparentées en identifiant des spécimens types analogues et des liens entre les enregistrements provenant de différentes sources. Cette fonctionnalité, associée à des outils de recherche puissants et à la visualisation d’un tableau de bord, permet d'étendre la portée des occurrences du GBIF aux traitements taxonomiques et aux publications.

“EJT has always aimed to be at the forefront of open-access taxonomic publishing. The new GBIF-hosted portal exemplifies this mission. By transforming our material citation records into dynamic, reusable data, we are not only supporting the scientific community but also fostering innovation in biodiversity research,” a déclaré Steven Dessein, président et cofondateur d’EJT, et président du Meise Botanic Garden. “Furthermore the portal allows us to better showcase and measure the impact of EJT’s contributions, making the journal’s role in advancing global biodiversity science more visible and quantifiable. This is a proud moment for EJT and its collaborators.”

EJT a été lancé en 2011 par un groupe de travail de l'European Distributed Institute of Taxonomy (EDIT) pour soutenir la transition du papier vers des revues taxonomiques numériques. Aujourd'hui, EJT est financé et publié par un consortium de 10 institutions d'histoire naturelle européennes, et est soutenu par le Consortium of European Taxonomic Facilities (CETAF). EJT couvre un large éventail de sujets de recherche taxonomique dans les domaines de la zoologie, de la botanique, de la mycologie et de la paléontologie. Depuis 2017, EJT a établi un partenariat avec l'organisation suisse Plazi (le plus actif des fournisseurs de datasets dans le GBIF) pour convertir les métadonnées, les traitements et le matériel des articles publiés en PDF dans des formats de données trouvables, accessibles, interopérables et réutilisables (FAIR) (XML Taxpub). Cela a permis de déposer les articles dans le Biodiversity Literature Repository et de les mobiliser dans des infrastructures de données telles que le GBIF et Catalogue of Life, ainsi que dans ChecklistBank. En veillant de manière proactive à la qualité et à la bonne diffusion des données, EJT améliore la découvrabilité et l'utilisabilité immédiates des informations taxonomiques publiées.

“This hosted portal represents the culmination of many years of collaborative efforts between Plazi, GBIF, and publishers,” a déclaré Donat Agosti, président de Plazi. “For the first time it provides a dual-view window: one for GBIF users, allowing them an insightful look into data about specimens, and another for publishers, presenting their rich, quality-controlled data that was traditionally confined within PDFs. The hosted portal provides a novel and unique view of the data in a publication and indeed, for a journal.”

À ce jour, plus de 86 000 occurrences à travers 1 445 datasets sont mobilisées dans le GBIF à partir des enregistrements publiés par EJT et disséminés par Plazi. Il est important de noter que ces enregistrements contiennent plus de 25 000 spécimens types. Les enregistrements mobilisés par EJT ont été largement cités, générant plus de 624 citations, dont 400 articles de journaux, 104 rapports et 76 preprints, et ont été largement réutilisés, y compris pour des études sur le climat, la santé, l'écologie et l'agriculture.

“The taxonomic data from EJT digitised articles contribute to the global effort of cataloguing all described organisms on earth,” a déclaré Olaf Bánki, directeur de Catalogue of Life. “EJT adds to the Catalogue of Life over 5000 scientific names, of which over 2000 are accepted species names and an equal number of synonyms. The EJT hostel portal highlights this work, and provides credit to the taxonomic community responsible for the underlying taxonomic data and occurrences.”

“EJT has been exemplary in handling nomenclatural data, which for zoology means mandatory registration in ZooBank of works published electronically, and the journal has gone further by also registering every new animal name,” a déclaré Thomas Pape, président de l’International Commission on Zoological Nomenclature. “We are now seeing the natural next step of making the specimen-level occurrence data associated with the scientific names even more discoverable and retrievable, so that the data will be put to use much beyond taxonomy for a better understanding and management of the natural world to the ultimate benefit of human well-being.”

Lien vers le portail : https://data.europeanjournaloftaxonomy.eu/